Hakkında Kutlu Adalı cinayeti nedeniyle soruşturma açılan Sedat Pekerin kardeşi Atilla Pekerin müracaat savcılığına verdiği ve kamuoyuna imzasız nüshanın yansıdığı dilekçede, gazeteci Kutlu Adalıyı öldürmek için eski MİTçi Korkut Ekenle Kuzey Kıbrısa gittiklerini iddia etti. Pekerin iddiaları sonrası konuya ilişkin açıklama yapan Eken, cinayet iddialarını reddederken, Pekerle Kuzey Kıbrısa gittiğini doğruladı.
Sözcü gazetesinden Saygı Öztürke konuşan Eken, Kuzey Kıbrısa gittiği süreci, Hasan Paşa (Dönemin Barış Kuvvetleri Komutanı Korgeneral Hasan Kundakçı) telefon etmiş. Kundakçı, Emniyet Genel Müdürü Mehmet Ağara, ‘Kıbrısta çok büyük PKK faaliyetleri var. Teröristler burada cirit atıyor falan demiş ve bu konuda yardım istemiş. Ben de o dönemde Emniyette Özel Harekat Polislerini yetiştirmekle görevliyim. Mehmet Bey de beni gönderdi. Her ihtimale karşı doğru, Sedat Pekerin kardeşi Atilla Pekerle gittim, ben çağırdım. PKKnın oradaki faaliyetlerine yönelik 3-5 günlük bir inceleme yaptım. PKKnın yaralılarını Kıbrısa götürdüğünü tespit ettik. Rum kesiminde tedavi edildikten sonra Yunanistanda bulunan Lavrian kampına teröristler sevk ediliyordu. Bunları ben raporladım ve Kolordu Komutanı Hasan Kundakçı paşama verdim sözleriyle anlattı. 
Korkut Eken (sağda) Kutlu Adalı cinayetiyle suçlanıyor
Ben Sedat Pekere ne yaptımsa aşırı bir düşmanlığı oluşmuş
Emekli Orgeneral ve eski Jandarma Genel Komutanı Galip Mendiyi ziyaretine ilişkin olarak da konuşan Eken O dönem Albay rütbesinde olan Galip Mendi Paşa benim çok sevdiğim kahraman askerlerden birisidir. Gitmişken kendilerini ziyaret ettim. Lefkeye gideceğim zaman da otomobil verdiler. Şimdi duyuyorum ki Atilla Peker, gazeteci kutlu Adalının öldürülmesi olayı ile ilgili olarak C.Savcılığına suç duyurusunda bulunmuş. Sebep? Ben Sedat Pekere ne yaptımsa aşırı bir düşmanlığı oluşmuş. Atilla Pekerin buna alet olmaması lazım. Nasıl yaptı bilmiyorum ifadesini kullandı.
Ekenin açıklamaları şöyle:
Gazeteci olduğu belirtilen Kutlu Adalıyı tanımıyorum ki
Gazeteci olduğu belirtilen Kutlu Adalıyı tanımıyorum ki hakkında bir kelime konuşayım. Olayın araştırılması için suç duyurusunda bulunacağım. Siyasiler birbirlerine sahip çıkıyor. Eee bizi kim kollayacak. Sahip çıkan yok. Kutlu Adalı olayının faillerini bilenler, benim de bir ilgim olmadığını biliyorlardır. Bir kişi yok mu yani ‘Korkut Ekenin bir ilgisi yoktur diyecek adam. ‘Allahtan korkun diyen yok maalesef.
Susurluk olayında yalan söyleyemediğim için hapis yattım
(Kutlu Adalı suikastıyla niçin gündeme geldiniz? sorusu üzerine) Vallahi, billahi bilmem, tanımam. Olsa da söylerim. Ben doğruyu söylerim. Susurluk olayında yalan söyleyemediğim için 6 yıl hapis cezasına çarptırıldım, 2.5 yıl hapis yattım.
Süleyman Soyluya tepki
Süleyman Soylu konuşuyor ama beni hiç tanımaz. ‘Korkut Ekeni ben sevmem, karanlık bir tiptir diyor. Şimdi yolda bir polis araması olsa bana nasıl davranacaklar? Karanlık tipim. İçişleri Bakanı öyle söylemiş çünkü. Allah korkusu olması lazım. Polis Özel Harekat Timlerinin kuruluşuna bakmış mı? Kimler ne kadar emek vermiş, kimler ne kadar çalışmış biliyor mu? 1980li yıllarda onun temelini attım. O zaman Süleyman Soylu kaç yaşındaydı? Benim 53 yaşında oğlum var. Yani günah.
Devletin yetkilileri, bu işlerle ilgili olmadığımı niçin söylemiyorlar?
Sedat Pekerle benim aramda bir şey yok ama bir kin bir garezle nereye gittiyse, mahkemeye gittiyse benim ismimi zikretti. İftiralarla aşağılamaya çalıştı. Niçin böyle yaptığının sebebini vallahi bilmiyorum. Kimseyle görüşmüyorum. Onunla da görüşmüyorum. 2004te cezaevinden çıktıktan sonra kimseyle görüşmüyor, tek başıma yaşıyorum. Korkut Ekenin de çocukları, torunları var. Katil miyim ben? Devletin yetkilileri, istihbarat birimleri bilmiyorlar mı? Bu işlerle ilgili olmadığımı niçin söylemiyorlar?
Hakkımdaki iddianın araştırılmasını isteyeceğim
(İddiaların araştırılması için siz de C. Savcılığına başvuracak mısınız? sorusu üzerine) Tabii ki başvuracağım, hakkımdaki iddianın araştırılmasını isteyeceğim. Bu Susurluk, faili meçhulleri biliyorsam kendi adıma şerefsizim. Ben özel harekat polislerini sadece eğittim. Ben, PKK ile mücadele ettim. Şehirlerde işim olmadı, olmaz da. Bir kez daha belirtiyorum Kutlu Adalıyı tanımıyorum, bilmiyorum adını da duymamıştım. Gazeteci ile ne işim olur? PKK ile mücadelem var.
